计算机科学与系统生物学杂志

作者须知

《计算机科学与系统生物学杂志》提供与计算机科学与系统生物学相关的所有领域的快速双月刊文章。《计算机科学与系统生物学杂志》欢迎提交符合重要性和科学卓越性一般标准的稿件。论文将在接受后大约一个月内发表。

该杂志的关键功能领域包括人工智能、机器人、植物系统生物学、癌症系统生物学、进化GenHILARIS SRL、计算生物学、数学生物学、生物统计学、细胞系统生物学、随机模型、生物建模、分子系统生物学、神经网络、无线网络、计算科学等。
作为出版商国际链接协会 PILA 的成员，《计算机科学与系统生物学杂志》（HILARIS SRL）遵循知识共享署名许可和学者开放获取出版政策。

通过https://www.scholarscentral.org/submissions/computer-science-systems-biology.html 提交稿件 或以电子邮件附件形式发送至编辑部editor@hilarispublisher.com

稿件编号将在 72 小时内通过电子邮件发送给通讯作者。

注意：作者对其研究论文中的任何科学不端行为（包括抄袭）承担全部责任；出版商对任何已发表的研究文章中发生的任何科学不当行为不承担任何责任。作为出版商，我们将严格遵循科学指南和 EIC 的建议，如果任何文章中出现科学不当行为或错误，我们将随时撤回或勘误任何文章。

HILARIS SRL 关于 NIH 授权的政策

HILARIS SRL 将在发表后立即将 NIH 资助者和欧洲或英国生物医学或生命科学资助者的文章发布版本发布到 PubMed Central，为作者提供支持。

编辑政策和流程

《计算机科学与系统生物学杂志》遵循渐进的编辑政策，鼓励研究人员以文章的形式提交原创研究、评论和编辑观察，并有表格和图形表示形式的充分支持。

文章处理费 (APC)： 

平均文章处理时间 (APT) 为 55 天

快速出版服务

Hilaris Publishing 为未来的作者提供广泛的机会、选择和服务来发表他们的学术贡献。

该期刊满足快速出版的需求，同时不影响编辑质量，包括稿件同行评审。提供这种灵活性是为了确保最早的作者对其各自贡献的可信度，这也将确保及时传播研究成果，以实现有效整合、有效翻译和减少冗余。

作者可以选择标准开放获取出版服务，该服务需要自己的时间来完成完整的出版过程，也可以选择快速出版服务，其中文章最早发表（包括多位学科专家委托以确保最早的同行- 审查评论）。作者可以根据个人偏好、资助机构指南或机构或组织要求利用这种灵活性。

无论选择哪种方式，所有手稿都经过彻底的同行评审过程、编辑评估和制作过程。

快速编辑执行和评审流程（FEE-评审流程）

愿意在此模式下发表文章的作者可以预付 99 美元，用于快速同行评审和编辑决定。自提交之日起 3 天内做出第一次编辑决定，并在 5 天内做出最终决定并附上审阅意见。条样校样生成将在接受后 2 天内或最多 5 天内完成（对于外部审稿人通知修改的稿件）。

接受出版的稿件将收取常规 APC 费用。

作者保留其出版物的版权，文章的最终版本将以 HTML 和 PDF 格式以及 XML 格式发布，以便传输到索引数据库。该杂志的编辑团队将确保遵守科学出版指南。

Journal of Computer Science & Systems Biology 由 HILARIS SRL 组织，该组织是一个自负盈亏的组织，不接受任何机构/政府的资助。因此，该期刊的运营资金完全来自作者和一些学术/企业赞助商收取的手续费。手续费需用于维持期刊的维护。作为开放获取期刊，《计算机科学与系统生物学杂志》不收取订阅费用，因为这些文章可以通过互联网免费获取。文章作者需要支付公平的处理其文章的手续费。但是，不收取任何提交费用。作者只有在其稿件被接受发表后才需要付款。基本文章处理费或稿件处理费如下所述的价格。另一方面，它可能会因广泛的编辑、彩色效果、复杂的方程、文章数量或页数的额外延长等而有所不同。  

文章提交为了减少延迟，作者应在从稿件提交到每个修订阶段的每个处理阶段遵守 HILARIS SRL 期刊的级别、长度和格式。提交的文章应有 300 字的摘要/摘要，与正文分开。摘要应通过明确说明研究目的和采用的方法来简要介绍工作，并简要强调主要发现。文本可能包含一些简短的副标题，每个副标题不超过 40 个字符。

HILARIS SRL 投稿格式HILARIS SRL 接受各种格式的文学作品，例如研究文章、评论、摘要、附录、公告、文章评论、书评、快速通讯、给编辑的信、年会摘要、会议记录、日历、病例报告、更正、讨论、会议报告、新闻、讣告、演讲、产品评论、假设和分析。

文章准备指南

• 作者应附上一封完整提及稿件类型的电子求职信（例如，研究文章、评论文章、简要报告、案例研究等）。除非受特殊情况邀请，否则作者不能将特定稿件归类为社论或致函编辑或简洁的通讯。
• 确认每个被指定为作者的个人都符合《计算机科学与系统生物学杂志》作者标准的统一要求。
• 请确保提交审阅/出版的文章不会同时在其他地方考虑。
• 明确提及稿件中报告的工作的商业来源的经济支持或利益，或任何作者可能拥有的任何其他经济利益，这可能会产生潜在的利益冲突或出现利益冲突去工作。
• 平铺页面中必须提供清晰的文章标题以及作者的完整详细信息（专业/机构背景、教育资格和联系信息）。
• 通讯作者应在稿件首页注明地址、电话号码、传真号码和电子邮件地址，文章发表后，作者必须解决与他人的任何利益冲突。
• 对所有工作表连续编号，包括参考文献、表格和图例。
• 扉页是第 1 页。在第一页上，键入标题（每页顶部的短标题）、标题（不能包含任何缩写词）、作者姓名及其学位、资助或其他资助者的姓名研究、通信和重印请求的地址，以及通讯作者的电话、传真号码和电子邮件地址。

研究文章指南

• 研究文章是根据使用明确定义的研究方法收集的经验/二手数据撰写的文章，其中结论是根据对收集的数据的分析得出的。
• 这些信息必须基于补充计算机科学和系统生物学知识体系的原创研究。
• 文章应对所提供的数据进行批判性描述或分析，同时添加该领域新的和快速发展的领域。
• 包括最多 300 个单词的摘要，其中包含 7 到 10 个重要关键字。
• 摘要应分为目标、方法、结果和结论。
• 研究文章必须遵循介绍的格式，然后简要回顾相关文献、应用的方法（收集数据）、讨论和参考文献、表格和图例。

评论文章

• 评论文章主要是根据与期刊主题相符的二手数据撰写的。它们是针对相关主题的特定方面的简短但批判性的讨论。评论通常以问题陈述开始，并附有 300 字的简短摘要和几个关键词。引言通常将问题向读者提出，然后在必要时借助必要的表格、图表、图片和插图进行分析讨论。它总结了主题并得出了结论。评论文章中的所有陈述或观察必须基于必要的引用，并在文章末尾提供完整的参考。

评论

• 评论是主要由资深和经验丰富的作家撰写的针对特定发展、最新创新或符合期刊主题的研究成果的观点文章。它们是非常简短的文章，标题和摘要提供了要讨论的主题的要点，很少有关键词。它立即指出问题，并在必要时借助插图、图表和表格提供全面的分析。它用简短的结论总结了该主题，并在最后引用了参考文献。

案例分析

• 接受案例研究是为了添加与计算机科学和系统生物学领域进展的调查研究相关的额外信息。
• 它应该通过提供有关核心领域的关键见解来为提交的主要内容/文章增加价值。病例报告必须简短并遵循清晰的格式，例如病例和方法部分（描述临床问题的性质以及解决该问题所采用的方法）、分析病例的讨论部分和总结整个病例的结论部分。

社论

• 社论是对当前发表的有关计算机科学与系统生物学的文章/问题的简明评论。编辑部可以联系任何此类作品，作者必须在收到邀请之日起三周内提交。

临床图像

• 临床图像只不过是计算机科学和系统生物学的照片描述，其不应超过 5 个图形和描述，不超过 300 个单词。一般来说，这里不需要参考文献和引文。如有必要，只能允许三个参考。
• 不要在临床图像中添加单独的图形图例；整个临床图像文字就是图例。图像应采用以下格式之一与稿件一起提交：.tiff（首选）或.eps。

给编辑的信/简明通讯

• 给编辑的信应仅限于对以前发表的文章的评论，并具体提及与之相关的问题和原因。对案例或研究结果的报告应当简明、全面、简短。它不遵循摘要、小标题或致谢等格式。它更多的是读者对发表的特定文章的回应或意见，应在文章发表后 6 个月内送达编辑。

致谢：本节包括致谢人员、资助细节、资金等。

注：如果作者未能按照上述说明提交作品，请保持清晰的标题，即标题、副标题。

参考文献：只有已发表或接受的稿件才应包含在参考文献列表中。会议摘要、会议演讲或已提交但尚未接受的论文不应被引用。所有个人通讯均应有相关作者的来信支持。HILARIS SRL 使用编号引文（引文序列）方法。参考文献按照它们在文本中出现的顺序列出并编号。在正文中，引用的内容应在括号中注明参考文献编号。一组括号内的多个引用应以逗号分隔。当有三个或更多连续引用时，应给出一个范围。示例：“...现在使生物学家能够在一次实验中同时监测数千个基因的表达 [1,5-7,28]”。在排序引文之前，请确保稿件的各个部分按照相关期刊的正确顺序排列。图标题和表格应位于手稿的末尾。要求作者为每一篇参考文献至少提供一个在线链接，如下（最好是 PubMed）。由于所有参考文献都将尽可能以电子方式链接到它们引用的论文，因此正确的参考文献格式至关重要。参考文献列表请使用以下格式：已发表论文示例

1. Laemmli UK (1970) 噬菌体 T4 头部组装过程中结构蛋白的切割。自然 227：680-685。
2. Brusic V、Rudy G、Honeyman G、Hammer J、Harrison L (1998) 使用进化算法和人工神经网络预测 MHC II 类结合肽。生物信息学 14：121-130。
3. Doroshenko V、Airich L、Vitushkina M、Kolokolova A、Livshits V 等。(2007) 来自大肠杆菌的 YddG 促进芳香族氨基酸的输出。FEMS 微生物快报 275：312-318。

注：请列出前五位作者，然后添加“et al”。如果还有其他作者。电子期刊文章 Entrez 编程实用程序
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK25500/ 

图书

1. Baggot JD (1999) 家畜药物处置原则：兽医临床药理学基础。(1sttedn)，WB Saunders Company，费城、伦敦、托兰托。
2. 张 Z (2006) 用于对临床样本中的蛋白质组表达谱数据进行差异分析的生物信息学工具。泰勒和弗朗西斯 CRC 出版社。

会议

1. Hofmann T (1999) 聚类抽象模型：从文本数据中无监督学习主题层次结构。国际人工智能联合会议论文集。

表格这些应该最少使用并设计得尽可能简单。我们强烈鼓励作者以 .doc 格式提交表格。表格全文均采用双倍行距，包括标题和脚注。每个表格应位于单独的页面上，用阿拉伯数字连续编号，并提供标题和图例。表格应该是不言自明的，无需参考文本。最好在图例中而不是在文本中描述实验中使用的方法的细节。相同的数据不应同时以表格和图表的形式呈现或在文本中重复。可以从 Excel 电子表格复制单元格并将其粘贴到 Word 文档中，但 Excel 文件不应作为对象嵌入。

注意：如果提交的内容为 PDF 格式，请作者保留 .doc 格式，以帮助成功完成流程。

图片照片图像的首选文件格式是 .doc、TIFF 和 JPEG。如果您在不同图层上创建了具有单独组件的图像，请将 Photoshop 文件发送给我们。所有图像必须等于或高于预期显示尺寸，并具有以下图像分辨率：艺术线条 800 dpi、组合（艺术线条 + 半色调）600 dpi、半色调 300 dpi。有关详细信息，请参阅图像质量规格表。图像文件的裁剪也必须尽可能接近实际图像。使用阿拉伯数字来指定数字，并使用大写字母来表示其部件（图 1）。每个图例以标题开始，并包含足够的描述，以便在不阅读手稿文本的情况下也可以理解该图。图例中给出的信息不应在文本中重复。

图例：应按数字顺序在单独的表格上输入这些图例。

作为图形的表格和方程式如果方程式无法在 MathML 中编码，请以 TIFF 或 EPS 格式作为离散文件（即仅包含一个方程式的数据的文件）提交。只有当表格无法编码为 XML/SGML 时，才能以图形形式提交。如果使用此方法，则所有提交的所有方程和表格中的字体大小必须一致且清晰，这一点至关重要。

补充信息所有补充信息（图、表和摘要图等）尽可能以单个 PDF 文件形式提供。文件大小在补充信息允许的范围内。图像的最大尺寸应为 640 x 480 像素（9 x 6.8 英寸，每英寸 72 像素）。

校样和重印电子校样将以电子邮件附件的形式以 PDF 文件形式发送给相应作者。页校样被视为稿件的最终版本，校样阶段不会对稿件进行任何更改。作者可以免费下载 PDF 文件。可根据要求提供文件的硬拷贝。请点击链接查看费用。https://www.HILARIS SRLonline.org/pdfs/HILARIS SRL-Group-reprints-order-form.pdf

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